蒋于湖州访戴时，心中仍挂念着广州之事，曾向许崇智写信，请他劝说孙中山速平陈炯明，然后北伐。

否则乱生肘腋，难以对付。

并说，但愿吾言不中。

孙中山北伐军，于6月13日攻克赣州。

同一日，陈炯明却下密令叛变。

14日，陈扣押廖仲恺于兵工厂。

15日，陈炯明部下叶举发通电要求孙中山下野。

16日凌晨3时，洪兆麟部炮轰孙中山总统府。

孙中山脱险后，到永丰舰指挥反击陈逆军。

宋庆龄于25日历尽艰辛返回上海。

而广州卫戍司令魏邦平却严守中立，不敢抵抗。

孙中山于18日急电蒋纬国，转告蒋介石急来广州。

蒋见电报后，于25日启程来粤。

29日即潜登永丰舰护卫孙中山。

蒋登舰后，孙中山命各舰移驻长州要塞后面的新造村一带，以免被叛军封锁。

7月8日，各舰顺利通过原来浅水处海心冈，转守长州要塞。

此时海军陆战队指挥官孙祥夫投降陈炯明，引敌登陆，长州失陷，各舰又危在旦夕。

蒋遂于7月10日商决孙中山率各舰冲过车歪炮台，驰往白鹅潭外国军舰停泊处，以避炮击。

正当永丰舰冲过车歪炮台时，永丰舰身中六弹，舰身震动，蒋急请孙中山入舱暂避，自己仍守在炮楼上。

二十分钟后，安全通过车歪炮台，蒋才舒了一口气，并深为孙中山受惊而内疚。

孙中山则喜形于色，对蒋多有嘉慰。

在白鹅潭，蒋经常乘夜色朦胧时，上岸采购食品、菜蔬，这期间，孙中山曾劝蒋为主义而奋斗，为革命而自重，予以慰勉，但语中也有批评他动辄任性使气的意思。

孙中山于遂于此处等待北伐军回师讨陈，以解危难。

但是，北伐军回师靖难之战于7月29日在韶关败北。

8月3日，许崇智率第二军退往南雄，继入福建；李烈钧赣军、朱培德滇军、陈嘉祐湘军则退往广西。

回师靖难已无可能。

孙中山获此消息后，即于8月9日下午离粤赴沪。

蒋陪孙中山自香港乘俄轮于14日抵上海，数千人到码头欢迎。

蒋在孙中山安顿好一切之后，于23日回浙。

到宁波游普陀山，天福庵、登南天门，六天后返回宁波城内。

这几天因吃的不合适，蒋连日闹肚子，但仍坚持写军事意见书，筹划方略。

主张先平陈炯明叛军，定广东，进而统一西南。

他还建议由李烈钧全权指挥，准备三个月，于11月开始作战。

对北方军阀，蒋主张惟吴佩孚不能联络，必使其投诚而后已。

其间，孙中山两次手谕召他到上海面谈，蒋均不从，只管自己于宁波各名胜游览。

孙中山为此怅怅不乐。

9月13日，蒋介石于宁波城内开始写《孙大总统蒙难记》。

记载6月15日至8月15日每天要事；到10月初写完全稿。

10月4日蒋到上海。