1993年，在巴基斯坦等国调节下，交战各方签署了《伊斯兰堡和平协定》和《贾拉拉巴德协议》。

但各派为争夺中央领导权而互不相让，对和谈、组织政权机构、举行大选等各执几见，拉巴尼与希克马蒂亚尔两派更是严重对立。

兴于战争

1994年8月，阿富汗伊斯兰学生民兵组织&ldo;塔利班&rdo;异军突起。

塔利班成立之初只有800人，但是塔利班高举铲除军阀、重建国家的旗帜，而且纪律严明、作战勇敢，并提出反对腐败、恢复商业的主张，因此深得阿富汗平民的支持和拥戴。

后来塔利班实力急剧膨胀，发展成为一支拥有近3万人、成百辆坦克和几十架喷气式战斗机的队伍。

1995年5、6月间，塔利班发动了代号为&ldo;进军喀布尔&rdo;的战役，一路势如破竹，很快控制了阿富汗近40％的地区。

塔利班乘胜向喀布尔发起全面攻击。

9月26日，塔利班占领了电台、电视台、总统府。

针对联合国组织阿富汗过渡政府的计划，塔利班提出了自己的条件，阿各派均表示反对，联合国的移交权力的方案被迫中止。

1996年1月，阿政府军在总指挥马苏德的领导下稳住了阵脚并不时反攻，使&ldo;塔利班&rdo;连续攻击喀布尔8个月都无法得手。

5月24日，拉巴尼政府与老对手希克马蒂亚尔经过一番秘密的讨价还价签署了一项政治和军事合作协议。

6月26日，希克马蒂亚尔重新进入喀布尔，出任政府总理，阿富汗成立了拉巴尼－希克马蒂亚尔联合政权，共同对付势力日益强大、已成为公认的实力最强的反政府武装&ldo;塔利班&rdo;。

1996年8月至9月，塔利班天内取得连连胜利。

9月25日，&ldo;塔利班&rdo;乘胜从东、西、南等方向向喀布尔发起全面进攻，27日宣布攻占首都喀布尔，成立了六人委员会，负责管理国家事务，宣布实行严格的伊斯兰政权。

从塔利班占领喀布尔后开始，拉巴尼政府军与杜斯坦姆领导的乌兹别克民兵及阿富汗伊斯兰党（哈里斯）派正式结盟，被称为反塔利班联盟。

1997年10月阿富汗改国名为阿富汗伊斯兰酋长国。

1998年，塔利班与反塔利班联盟几经交战，塔利班逐步成为了阿富汗的主导力量，控制着包括首都喀布尔在内的阿富汗90％以上的领土。

阿富汗内战让阿富汗付出了惊人的代价。

尽管阿富汗在地图上还存在，但它作为一个国家行使主权的能力已经瘫痪。

许多城市在战争中被夷为平地，水源供应不足，健康护理完全消失，只有少数幸运的人可以受到正统的教育。

上百万阿富汗人丧生，几百万难民逃到邻近的巴基斯坦和伊朗。

塔利班属于伊斯兰教逊尼派，信奉原教旨主义，致力于&ldo;建立世界上最纯粹的伊斯兰国家&rdo;。

塔利班政权实行高度的中央集权制，组织结构严密，总部设在坎大哈。

塔利班在其控制的地区，全面推行伊斯兰法，实行极端宗教统治，甚至专门颁布政令禁止电影电视，严格控制娱乐活动，男人必须蓄须，女人必须蒙面，不允许妇女接受教育和就业，违者将受到严厉惩罚。