于是，军种间的内部争斗又全面展开了。

自然是不甘寂寞的麦克阿瑟首先发难，他责怪华盛顿束缚了他和整个陆军的手脚，他绝对无法容忍的是，当尼米兹指挥的以海军为核心的各级司令部进攻日本本土的同时，让他在南边&ot;坐冷板凳&ot;。

因此，他把建立一个由他指挥的统一司令部的观点再度提出来。

但他的观点遭到了来自海军的难以辩驳的反对。

4月3日，参谋长联席会议颁布了一项折衷方案：在进攻日本时，麦克阿瑟将指挥太平洋地区的全部陆军地面部队和航空兵；尼米兹指挥太平洋的全部海军。

这一方案意味着将进一步分裂被尼米兹称之为&ot;不能团结工作&ot;的联合指挥部；同时，任何陆军部队将来都难以听从海军将领的指挥。

尼米兹的耐心已经到了极限，他感到不能再次退让，否则，他将沦为麦克阿瑟的部属，而丧失自己的权力和责任。

他以不容置疑的语言向麦克阿瑟的特使萨瑟兰亮出了自己的观点：&ot;我现在不能答应把对于太平洋海区防务和作战计划不可或缺的陆军部队的作战指挥权交给他。

&ot;

然而，尼米兹也认识到，早日结束战争，比起两人的不和以及武装部队中两个局部的冲突来说，要重要得多。

基于这一考虑，他还是决定去马尼拉与麦克阿瑟会商，以取得双方的某种一致，尽早结束战争。

在两天的会晤中，两位高级将领尽可能以理智的态度去争取相同的目标，以谋求双方会谈的基点和最终从海、陆、空三方逼近日本的战略。

会谈解决了一些存留的问题，奠定了进攻日本九州、本州及其他岛屿的合作基础。

按照双方达成的协议，在两栖进攻中，以海军将领为主、陆军将领为辅进行指挥。

尼米兹答应将进攻整个琉球群岛的任务移交给麦克阿瑟，并保证一如既往地为西南太平洋部队提供海上掩护。

这次会谈，使尼米兹意识到，他的统一指挥陆、海军的愿望，是非常不现实的，他将再也不会提及全国范围的武装部队实行统一指挥的建议了。

2月的一天，一位年轻的海军中校来到太平洋舰队总部，捎来金上将带给尼米兹的一份绝密文件。

文件告知，当量为2万吨tnt的原子弹已经研制成功，将于1945年8月1日在太平洋战场使用。

一颗炸弹就能毁灭一座城市，全部或几乎全部杀死其居民，尼米兹对此深为惊讶。

他在座椅中转过身来注视着窗外，然后站起来对青年军官说：&ot;非常感谢你。

&ot;并喃喃自语道：&ot;我想，我是生不逢时，出世太早了。

&ot;

此时，7月的&ot;奥林匹克行动&ot;计划和&ot;王冠行动&ot;计划已由继任总统杜鲁门批准在8月实施。